Salut ,ben voila j'ai installé w2000 sur un disque dur ,alors que j'ai w98se sur un autre ,au demarrage c'est w2k qui demarre mais dans les optons de boot w98se n'apparait pas ,comment le faire apparaitre ???

Quand on démarre Win9x depuis le menu de Win2k, il boote sur la partition Win9x.
Or seules les partitions du disque de boot (premier disque du premier contrôleur) sont bootables.
 
Si j'ai pas été clair: c'est pas possible. Faut que les 2 OS soient sur le même disque.

Non tu n'es pas très clair.
Aucune nécessité à implanter les 2 OS sur le même disque.Simplement il faut d'abord installer win9x sur la partition primaire active, puis win2K n'importe où, dont l'install crée le multiboot en implantant quelques fichiers sur la partition active.
A+

J'ai une petite remarque, peut-être con mais ça fera avancer un peu le shmilblik :
 
On peut pas le faire sans rien changer en installant un truc style PQBOOT ??

c'est loin d'étre con ta remarque
dans pqboot magicss
 
on choisi w98 et win 2000
on active boot magic
et au redémarrage il devrait demandr win 98 ou win 2000