Aide script python

Marsh Posté le 03-11-2004 à 13:00:11

Bonjour à tous.
Je débute en python, et j'ai besoin d'un peu d'aide.
Je voudrais créer un script me permettant à partir d'un fichier.txt où il y a une chaine de caractère sur plusieurs lignes créer un autre fichier ou chaque ligne de cette chaine ne fait que 50 charactères.

voila mon oeuvre qui ne marche pas :??: :

Code :

#! /usr/bin/env python2
import string,re,sys
fasta=open("fichier.txt" ).readlines()
def write_fasta(seq, width=50):
"""write a sequence in fasta format.
The following parameters can be specified
seq - sequence as string
width - number of characters per sequence line (default 50)"""
for i in xrange(0, len(seq), width):
print seq[i:i+width]
write_fasta(fasta)

Le script m'affiche le fichier.txt mais pas avec 50 caractères par ligne.
Merci pour votre aide :hello:

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 13:00:11

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 13:46:04

à ton avis, readlines() ca fait quoi? [:itm]

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Stick a parrot in a Call of Duty lobby, and you're gonna get a racist parrot. — Cody

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 14:21:59

readline lit toutes les lignes de mon fichier....

Mais pourquoi ma fonction ne marche pas.
Mon width=50 n'est pas pris en compte...

Sinon, peut etre devrais-je me tourner sur la création d'un tableau de largeur 50 que je remplit par ma chaine de caractère?

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 14:43:52

...

a ton avis, readlines ca rend quoi en sortie?

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 15:34:09

Ben en gros, f.readlines() utilise f.readline() de façon répétitive, et retourne une liste contenant toutes les lignes de données du fichier.

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 15:39:22

bien, donc dans ton exemple, SEQ c'est quoi?

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 15:52:12

J'ai apprit que les variables de fonction ne doivent pas avoir les mêmes noms que les variables du programme général.
Pour moi, seq dans la fonction corresponf a Fasta dans le programme.
Le programme met donc en mémoire, Fasta qui correspond à la liste de toutes les lignes de mon fichier et cette variable est assimilée à Seq dans la fonction.
Non?

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 16:01:32

je te demande LE TYPE de seq.

je sais bien à quoi ca correspond et pourquoi tu l'utilises, mais je veux que tu me donnes son type et que tu te poses des questions à ce propos

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Marsh Posté le 03-11-2004 à 16:07:57

Petite aide supplémentaire:
regarder dans la doc les différences entre les fonctions readline() et read()

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